罗小民 博士
Xiaomin Luo, Ph.D

副研究员
Associate Professor


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Email: xmluo@iris3.simm.ac.cn
 

学历

1990.9-1994.6
1994.9-1997.6
1997.9-2000.7
华东师范大学,化学专业,本科
华东师范大学,物理化学专业,硕士研究生
中科院上海药物研究所,有机化学专业,博士研究生
 

工作简历

2000.7-2002.2
2002.3至今
中科院上海药物研究所,有机化学专业,助研
中科院上海药物研究所,有机化学专业,副研
 

培训进修

2000.9-2000.12           新加坡国立大学,HIV水解酶抑制剂的抗药性研究
 

社会兼职

2001至今
1999至今
中国药学会会员
上海市分子科学研究会会员
 

研究领域

  1. 药物设计方法研究
    开展计算机辅助组合化学库的设计以及计算机虚拟筛选的研究,利用小分子与受体的结合能、类药性(包括LogP、分子量、氢键给体数、氢键受体数以及柔性键数)为打分函数,对虚拟组合化学库进行评价,并利用遗传算法对虚拟组合化学库进行优化。
    开展分子对接方法研究,目标是发展具有自主知识产权的分子对接程序,该程序将整合不同精度的分子对接策略,既可用于大规模数据库、虚拟组合化学库的筛选,又能用于确定小分子抑制剂与生物大分子靶标的准确结合构象。根据不同的精度需求,该程序能够提供不同层次的考虑生物大分子柔性的分子对接方法,另外,通过分子溶剂可及性表面和熵等物理量的计算方法,可以提供多种结合自由能计算方法,用于评价抑制剂与大分子的结合活性。
    通过对自由能微扰、靶向分子动力学方法、原子力显微镜方法以及蒙特卡罗模拟方法的研究,发展新的分子模拟方法,以用于药物作用机理、生物大分子生理功能的研究。
  2. 药物设计与分子模拟研究
    参与乙酰胆碱酯酶抑制剂、酪氨酸激酶、b-分泌酶、钾离子通道和基质金属蛋白酶的抑制剂设计,发现了多个有活性的化合物。
    参与天然产物数据库(目前有7万多个化合物)的构建,为进一步建立中药信息库奠定了基础。
 

论文

  1. Xiaomin Luo, Cheng Feng, Xiaojian Tan, Changheng Tan, Dayuan Zhu, Jianhua Shen, Xiaoqin Huang, Tong Liu, Kaixian Chen, Hualiang Jiang*, Weiliang Zhu, Chum Mok Puah, Hay Dvir, Michal Harel, Joel L. Sussman, Israel Silman. Structural Feature of AChE Inhibitor Huperzine B in Nature and in the Binding Site of AChE: Density Functional Theory Study Combined with IR Determination. J. Theor. Comp. Chem., 2002, 1: 81-92 (invited paper). [New journal, has not IF yet]
  2. Xiaomin Luo, Hualiang Jiang, Yongming Zhu, Xiaoqin Huang, Jingkang Shen, Kaixian Chen, Ruyun Ji. Anti-AIDS agents. 3D-QSAR study on betulin derivatives. AFMC, International Medicinal Chemistry Symposium. Beijing. 1999, Sep. (会议论文)
  3. Xiaomin Luo, Hualiang Jiang, Xiaoqin Huang, Kaixian Chen, Ruyun Ji. Theoretical study on the interaction between nitronic oxide. The Seventh National Conference on Quntum Chemistry of Chinese Chemistry Society. Fuzhou. 1999. (会议论文)
  4. Zhou Wei-Liang, Luo Xiao-Min, Jiang Hua-Liang, Gu Jian-De, Chen Jian-Zhong, Chen Kai-Xian, Ji Ru-Yun. Molecular design study of fulgide photochromic materials. Acta Chimica Sinica. 1999, 57(2): 132-138. [ 0.435]
  5. Feng Cheng, Jianhua Shen, Xiaomin Luo, Hualiang Jiang, Kaixian Chen. Steered Molecular Dynamics Simulations on the “Tail Helix Latch” Hypothesis in the Gelsolin Activation Process. Biophys. J. 2002, 83(2): 753-762. [4.636]
  6. Xiaoqin Huang, Liaosa Xu, Xiaomin Luo, Kangnian Fan, Ruyun Ji, Gang Pei, Kaixian Chen, Hualiang Jiang. Elucidating the Inhibiting Mode of AHPBA Derivatives against HIV-1 Protease and Building Predictive 3D-QSAR Models. J. Med. Chem., 2002, 45(2): 333-343. [4.139]
  7. Hong Liu, Ming Ji, Xiaomin Luo, Jianhua Shen, Xiaoqin Huang, Weiyi Hua, Hualiang Jiang, Kaixian Chen. New p-Methylsulfonamido Phenylethylamine Analogues as Class III Antiarrhythmic Agents: Design, Synthesis, Biological Assay and 3D-QSAR Analysis. J. Med. Chem., 2002, 45(14): 2953-2969. [4.139]
  8. Meng Cui, Xiaoqin Huang, Xiaomin Luo, James M. Briggs, Ruyun Ji, Kaixian Chen, Jianhua Shen, Hualiang Jiang. Molecular Docking and 3D-QSAR Studies on Gag Peptide Analogue Inhibitors Interacting with Human Cyclophilin A. J. Med. Chem. 2002, 45: 5249-5259. [4.139]
  9. Feng Cheng, Ruihao Zhang, Xiaomin Luo, Jianhua Shen, Xin Li, Jiande Gu, Weiliang Zhu, Jingkang Shen, Irit Sagi, Ruyun Ji, Kaixian Chen, Hualiang Jiang. Quantum Chemistry Study on the Interaction of the Exogenous Ligands and the Catalytic Zinc Ion in Matrix Metalloproteinases. J. Phys. Chem. B. 2002, 106(17): 4552-4559. [3.379]
 

专著

  1. “陈凯先,蒋华良,嵇汝运,计算机辅助药物设计-原理、方法及应用”、专著,上海科技出版社,2000。
  2. 罗小民,蒋华良,陈凯先,“生物信息学与药物设计”,生物信息学,赵国屏主编,专著,科学出版社,2002。
  3. 蒋华良,沈建华,罗小民,陈凯先,计算化学与有机化学和生命科学, 杜灿屏主编,21世纪有机化学发展战略报告,专著,化学工业出版社,2002。
  4. 罗小民,蒋华良,沈建华,陈凯先,“药物设计与分子模拟”,药学年鉴(2002)。