沈建华，男， 1965年7月生，浙江湖州市人。1987年毕业于国防科学技术大学材料系，1987年9月至1992年7月在航天工业部一六五厂工作任工程师;1995年硕士毕业于西安交通大学大学电子工程系，1995年9月进入复旦大学物理学系学习，获得理学博士学位,同年进入中国科学院上海药物研究所博士后流动站从事药物设计研究, 2000年出站留所工作,任副研究员、研究员、博士生导师、课题组长。

沈建华研究员的研究领域涉药物设计、计算分子生物物理化学和网格高性能计算技术。已在 JACS、JMB、Biophys. J等SCI杂志上发表论文20余篇，申请专利5项。先后承担5项国家、上海市基金项目，包括国家“863”高科技基金项目、国家自然科学基金项目、上海市青年科技启明星基金项目和上海市抗非典专项科研基金项目等。获得2000年中法Servier青年药物化学奖、2003年度上海科技进步一等奖和2003年上海市“优秀专业技术人才”称号。

研究方向

• 针对脂质代谢疾病的药物设计
  
  以 RXR异源二聚的核受体PPAR、LXR、FXR为靶标蛋白，利用计算机药物设计技术结合实验研究，设计出多靶标作用的活性化合物结构。然后，通过研究药物的作用途径，以期发现组织特异的具有调节血脂、胆固醇和增加胰岛素敏感的药物先导化合物。
  
• 针对 SARS CoV病毒 半胱氨酸蛋白酶的抑制剂设计
  
  通过模建 SARS CoV病毒 半胱氨酸蛋白酶的3维结构，利用高性能并行计算，虚拟筛选多个化合物或药物分子数据库，发现具有不可逆结合的半胱氨酸蛋白酶抑制活性的化合物，然后通过蛋白－化合物结合测试、化合物抑制酶水解活性测试以及化合物治疗和保护SARS病毒感染细胞实验，发现和确证抗SARS病毒药物 先导化合物。
  
• 生物医药复杂分子体系的分子动力学研究
  
  应用分子动力学方法模拟包括 HIV逆转录酶、3CL 蛋白酶、核受体等蛋白质构像运动，从结构和运动出发阐明其功能的实现过程；改进靶向分子动力学方法，模拟药物与靶标蛋白（如Hupzine A与乙酰胆碱酯酶）的结合和解离过程、以及蛋白与蛋白的相互作用（如脂结合蛋白与核受体）过程，从动态水平上揭示相互作用的分子机理；采用Car－Parrnello分子动力学模拟，从量子力学水平研究质子在生物环境中运动特征。
  
• 网格计算技术研究
  
  整合异地、异构的高性能计算资源，集成和优化多种药物设计软件，设计新药研究应用网格方案，开发应用网格界面和相关中间软件，建立新药研究应用网格并纳入国家网格工程，提供新药虚拟筛选的网格计算服务。

代表论文

1. Yechun Xu, Jianhua Shen* , et al., How Does Huperzine A Enter and Leave the Binding Gorge of Acetylcholinesterase? Steered Molecular Dynamics Simulations J. AM. CHEM. SOC . ( 2003) 125, 11340-11349.
2. Jianhua Shen, et al., Virtual Screening on Natural Products for Discovering Active Compounds and Target Information, Current Medicinal Chemistry , ( 2003) 10, 2327-2342.
3. Lingling Shen, Jianhua Shen* , et al. Biophys. Journal, (2003) 84 ， 1-17. Steered Molecular Dynamics Simulation on the Binding of NNRTI to HIV-1 RT.
4. Xiaoqin Huang, Jianhua Shen* , et al., Biophysical Journal , (2003) 84, 171-184. Molecular Dynamics Simulations on SDF -1a : Binding with CXCR4 Receptor
5. Jianhua Shen ， Hualiang Jiang and Kaixian Chen, “Molecular Simulation and Design in Drug Discovery”, Jun. 2002, Edinburg , The BBSRC/CNCBD Workshop on E-science.
6. Feng Cheng, Jianhua Shen* et al., Biophysical Journal, (2002) 83, 753-762. Steered Molecular Dynamics Simulations on the “Tail Helix Latch” Hypothesis in the Gelsolin Activation Process
7. Meng Cui, Jianhua Shen*, et al., J. Mol. Biol. , (2002) 318, 417-428. Brownian dynamics simulations of the recognition of the Scorpion toxin P05 with the small-conductance Calcium-activated potassium channels.